नर्मदा नदी के जल विवाद पर निर्णय देने हेतु गठित नर्मदा जल विवाद अधिकरण ने अपने अंतिम आदेश में अपने निर्णयों तथा निर्देशों को लागू करने के लिए एक तंत्र स्थापित करने का आदेश दिया। तदनुसार, केन्द्र सरकार ने अधिकरण के निर्णयों को लागू करने के लिए नर्मदा नियंत्रण प्राधिकरण के गठन के साथ-साथ नर्मदा जल योजना भी तैयार की। प्राधिकरण के मुख्य कार्य हैं:-
इंजीनियरिंग कार्य सहित नर्मदा बेसिन में सभी परियोजनाओं के कार्यान्वयन पर्यावरणीय सुरक्षा उपाय करना, पुनर्वास कार्यक्रम चलाना तथा उपर्युक्त परियोजनाओं को स्वीकृति देनते समय केन्द्र सरकार द्वारा निर्धारित की गई निबंधन और शर्तों का ईमानदारों से अनुपालन सुनिश्चित करना हेतु समग्र समन्वय और निर्देश देना।